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논문 기본 정보

자료유형
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저자정보
저널정보
대한생화학·분자생물학회 Experimental and Molecular Medicine Experimental and Molecular Medicine 제49권
발행연도
2017.1
수록면
1 - 10 (10page)

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Gliosarcoma (GS) is a rare variant (2%) of glioblastoma (GBM) that poses clinical genomic challenges because of its poor prognosis and limited genomic information. To gain a comprehensive view of the genomic alterations in GS and to understand the molecular etiology of GS, we applied whole-exome sequencing analyses for 28 GS cases (6 blood-matched fresh-frozen tissues for the discovery set, 22 formalin-fixed paraffin-embedded tissues for the validation set) and copy-number variation microarrays for 5 blood-matched fresh-frozen tissues. TP53 mutations were more prevalent in the GS cases (20/28, 70%) compared to the GBM cases (29/90, 32%), and the GS patients with TP53 mutations showed a significantly shorter survival (multivariate Cox analysis, hazard ratio=23.9, 95% confidence interval, 2.87–199.63, P=0.003). A pathway analysis showed recurrent alterations in MAPK signaling (EGFR, RASGRF2 and TP53), phosphatidylinositol/calcium signaling (CACNA1s, PLCs and ITPRs) and focal adhesion/tight junction (PTEN and PAK3) pathways. Genomic profiling of the matched recurrent GS cases detected the occurrence of TP53 mutations in two recurrent GS cases, which suggests that TP53 mutations play a role in treatment resistance. Functionally, we found that TP53 mutations are associated with the epithelial–mesenchymal transition (EMT) process of sarcomatous components of GS. We provide the first comprehensive genome-wide genetic alternation profiling of GS, which suggests novel prognostic subgroups in GS patients based on their TP53 mutation status and provides new insight in the pathogenesis and targeted treatment of GS.

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참고문헌 (26)

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Actor B / 2002 / Comprehensive analysis of genomic alterations in gliosarcoma and its two tissue components / Genes Chromosomes Cancer 34 : 416 ~ 427 google schola Amarasinghe KC / 2014 / Inferring copy number and genotype in tumour exome data / BMC Genomics 15 : 732 ~ google schola Biernat W / 1995 / Identical mutations of the p53 tumor suppressor gene in the gliomatous and the sarcomatous components of gliosarcomas suggest a common origin from glial ce google schola Cachia D / 2015 / Primary and secondary gliosarcomas: clinical, molecular and survival characteristics / J Neurooncol 125 : 401 ~ 410 google schola Cibulskis K / 2013 / Sensitive detection of somatic point mutations in impure and heterogeneous cancer samples / Nat Biotechnol 31 : 213 ~ 219 google schola

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